Храм был построен в 1310 году патриархом Нифонтом I в качестве кафоликона монастыря. В период османского владычества функционировал как мечеть, в то время как фрески его были скрыты, а золотая мозаика удалена.
Мозаичные шедевры эпохи Нифонта фрагментарно сохранились до наших дней в самых высоких точках основного храма и, в частности: на куполе - Пантократор (Вседержитель) и пророки, евангелисты - в сферических треугольниках, Додекаорт (двенадцать праздников) - на арках и западной стене, а также святые мученики.
Иконографическая программа росписи храма была дополнена фресками высокого художественного мастерства с изображением сцен из Ветхого и Нового Завета на символические темы и сюжеты, вдохновленные гимнографией.